ELETROFORESE DE ÁCIDOS NUCLÉICOS
João José de Simoni Gouveia
Luciana Correia de Almeida Regitano
A eletroforese é uma técnica utilizada para separar,
identificar e purificar
moléculas carregadas (como DNA e proteínas) (Maniatis,
1987). Este método foi
introduzido por Tiselius, no ano de 1937 (Brammer e
Iorczeski, 2002) e é simples,
rápido e capaz de separar fragmentos que não são
adequadamente separados por
outras técnicas (Sambrook e Russel, 2002).
A técnica apresenta basicamente um sistema de suporte (gel
de agarose, por
exemplo), um tampão no qual está imerso o gel e os eletrodos
nas extremidades da
cuba onde estão contidos o tampão e o gel.
Sob a influência de
um campo elétrico, moléculas carregadas e partículas
migram em direção ao pólo oposto. A carga e a massa das
moléculas fazem com
que elas migrem em velocidades diferentes e, portanto,
propiciam a separação
destas (Westermeier, 2005). Como os ácidos nucléicos (DNA e
RNA) possuem
carga elétrica negativa (devido ao grupamento fosfato) eles
sempre migrarão em
direção ao pólo positivo. Então, o fator determinante da
taxa de migração será a
massa da molécula (quando se fala em ácidos nucléicos, a
massa é diretamente
proporcional ao tamanho da molécula).
Existem vários meios de suporte que podem ser utilizados
(papel filtro,
membrana de celulose, gel de agarose, gel de
poliacrilamida). No caso dos géis, a
porosidade (que tem uma relação direta com a concentração de
agarose) determina
o poder de separação (Brammer, 2002). Na escolha do tampão,
o principal fator a ser considerado é sua capacidade
tamponante. Os dois tampões mais utilizados na eletroforese
de ácidos nucléicos
são o TAE (Tris, Acetato e EDTA) e o TBE (Tris, Borato e
EDTA). O TAE é mais
utilizado que o TBE, porém é mais facilmente exaurido durante
corridas longas ou
com alta voltagem. O TBE, apesar da melhor capacidade
tamponante, deve ser
evitado quando se deseja purificar os ácidos nucléicos do
gel (Ausubel, 1994).
Alguns fatores alteram a migração das moléculas através do
gel, dentre eles
podemos citar: concentração de agarose, conformação do DNA e
intensidade da
corrente.
A concentração de agarose atua de forma importante na
eletroforese, pois ela
determina a faixa de tamanho das moléculas de DNA que podem
ser separadas.
Para observar ácidos nucléicos em gel de agarose, deve-se
corá-los e
submetê-los a uma luz ultravioleta. O corante mais comum é o
brometo de etídeo,
que se intercala entre as bases do DNA (Ausubel, 1994).